A CCleaner egyik leghasznosabb funkciója az automatizált karbantartás, amely leveszi a válladról a rendszeres manuális takarítás terhét. A fizetős (Professional) verzióban elérhető Intelligens tisztítás funkció folyamatosan figyeli a háttérben a merevlemezt, és amint a felgyülemlett böngészési adatok, ideiglenes fájlok vagy rendszerhulladékok mennyisége elér egy előre beállított korlátot, a program automatikusan elvégzi a törlést. Ez biztosítja, hogy a háttértár soha ne teljen meg felesleges adatokkal, így megőrizhető a rendszer stabilitása és a szabad tárhely anélkül, hogy a felhasználónak külön figyelnie kellene a takarítási ciklusokra.
Emellett a CCleaner letöltés és installálás után lehetőséget biztosít az időzített ütemezésre is, amellyel meghatározhatod, hogy a program milyen gyakorisággal – például naponta, hetente vagy minden bejelentkezéskor – fussa le a karbantartási folyamatokat. Az automatizálás nemcsak a fájlok törlésére, hanem a böngészők bezárás utáni azonnali megtisztítására is kiterjedhet, ami növeli az adatvédelmet és a böngészési sebességet. Ezzel a módszerrel elkerülhető a merevlemez töredezettsége (HDD-k esetén) és a szükségtelen fájlok okozta lassulás, így a számítógép hosszú távon is megőrzi optimális teljesítményét.
